1992 előtt a Nemzeti Tankönyvkiadó Vállalat feladata volt az egyetemi, főiskolai hallgatók tankönyvvel és jegyzettel történő ellátása. A Tankönyvkiadó Vállalat több mint tízezer tankönyvet és jegyzetet gondozott és a Művelődési és Közoktatási Minisztérium támogatásával jelképes, a költségeket nem fedező áron értékesítette azokat. Az MKM az 1992/93-as tanévtől a felsőoktatási tanintézmények feladatává tette a tankönyv- és jegyzetellátást.

A Miskolci Egyetemen (a továbbiakban Egyetem) az 1992 előtt megjelent tankönyvek és jegyzetek kiadói joga a Tankönyvkiadó Vállalat jogutódjánál, a Nemzeti Tankönyvkiadó Vállalatnál maradt. Az új tankönyvek és jegyzetek megjelentetésére az Egyetemi Tanács 17/1992. számú határozata alapján a Miskolci Egyetemi Közlemények Szerkesztőségének átalakításával jött létre a Miskolci Egyetemi Kiadó (a továbbiakban Kiadó).

Az Egyetemi Kiadó szervezetileg 2011. január 1-től a Könyvtár, Levéltár, Múzeumhoz, felügyelet alapján az általános rektorhelyetteshez tartozik.